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1979年11月，中國自動化學會系統仿真專業委員會在山東煙臺召開了成立大會暨第一屆全國系統仿真學術會議，主任委員文傳源教授，專業委員會辦公室設在北京航空學院。1980年10月，在江西省廬山召開第二屆全國系統仿真學術年會，與會代表進行了廣泛交流與合作探討。1982年10月，在福建省廈門市鼓浪嶼召開第三屆全國系統仿真學術年會。1983年10月，在北京市香山別墅召開第四屆全國系統仿真學術年會。1984年與美國計算機仿真學會（SCS）主席W.Kuplus共同簽署了兩個學會進行合作與學術交流的備忘錄。10月，在江蘇省南京市召開了首屆仿真器學術年會，顯示了我國在仿真器研制方面取得的成績和長足進步。
1985年，仿真專業委員會被正式接納為IMACS團體會員，10月，在四川省成都市召開全國第五屆系統仿真學術年會。98個單位202名代表出席了會議。首期《系統仿真》雜志（暫定半年刊）正式出版，編輯部設在南京海軍軍訓器材研究所。1986年7月，在北京友誼賓館舉行由中國自動化學會系統仿真專業委員會主辦的“北京國際系統仿真學術研討會”，這是在我國舉辦的首次國際學術研討會。7月，文傳源、王正中前往日本，參加JSST學術會議，并代表系統仿真專業委員會與JSST簽訂合作協議。1987年10月，在湖南省慈利縣召開全國第六屆系統仿真學術會議。全國66個單位，135名代表參加會議。1988年8月，組團參加在法國巴黎召開的IMACS12屆大會，并與IMACS主席簽訂合作協議。9月，在山東青島召開仿真器及計算機圖形圖象學術交流會，青島海軍潛艇學院承辦。
1988年經國家科委（1988）國科發綜字第740號文件批準成立中國系統仿真學會，繼續保留中國自動化學會系統仿真專業委員會。九十年代，中國系統仿真學會處于初創時期，專業委員會的主要工作是配合中國系統仿真學會開展工作，但仍然先后組織了并行仿真、信息時代的仿真方法學、復雜系統仿真方法等專題討論會。
中國自動化學會系統仿真專業委員會自1999年起掛靠中國科學技術大學自動化系。經過改組后的專業委員會，決定恢復舉辦全國系統仿真技術及應用學術年會，組織出版發行“系統仿真技術及應用”系列論文集。
2002年換屆成立第8屆專業委員會，初步完成新老交接。2007年換屆，成立第9屆專業委員會。2010年換屆，成立第10屆專業委員會。2014年換屆，成立第11屆專業委員會。2019年8月第20屆"中國系統仿真技術及其應用學術年會"于新疆烏魯木齊召開，來自全國各地的專業委員會委員、高等院所的專家學者、企業的技術主管及論文作者出席了此次年會，此次會議產生了第12屆專業委員會名單。
代表性活動：學術年會，“中國系統仿真技術及其應用學術年會(CCSSTA)”
中國自動化學會系統仿真專業委員會第十二屆委員會
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